La historia mostrará a Joe Shimamura y el resto de cyborgs en su enfrentamiento contra Besudo, un grupo de personajes con poderes sobrenaturales y un gran intelecto que han manipulado la historia de la humanidad desde tiempos antiguos. Su objetivo es incierto, pero su alargada sombra afecta a muchos ámbitos del planeta.
 
Aunque pocas personas creen en la existencia de Bresudo, una periodista llamada Lucy Davenport se dirige a Texas para ponerse en contacto con cierta familia y se encuentra con los cybords. Estos fueron liberados de su labor de proteger a la humanidad cuando se establecieron los Guardianes de las Naciones Unidas y ahora viven en paz. Sin embargo, la visita de Lucy y la amenaza de Bresudo hace que Joe y el resto partan de nuevo a la batalla.
 
Kenji Kamiyama (GiTS: SAC, Higashi no Eden) será el director jefe del proyecto. Koudai Kakimoto (película de Psycho Pass) será el director de la película. Kamiya y Kakimoto ya colaboraron anteriormente en la película 009 Re: Cyborg, donde Kamiyama fue director y Kakimoto fue director de unidad. Signal.MD, el nuevo estudio subsidiario de I.G Port, animara las películas, siendo la producción de Ishinomori Production y de Production I.G. Masatsugu Saito será el diseñador de personajes.