Ese tipo de cuelgues solian hacermelo mothers pinchadas en el laburo, y mas todavia si decis que el cooler del chipset no esta funcando (igual quizá sea una función de ahorro, fijate si cuando anda normalmente gira bien). Como prueba al vuelvo podes hacer lo que dice holy de resetear (fijate como, depende de la mother), no perdes nada con probar y es un segundo nomas.
Y yo pienso que no debe ser un problema puntual del disco, xq es raro que te deshabilite todos los sata directamente... Pero lo que podes hacer es probar desconectar todas las unidades sata y probar con algun IDE (instalale algun Win asi nomás). Quiza sea mas molesto hacer ese tipo de pruebas, pero con eso te sacas la duda de si es alguna unidad sata o no. Porque lo ultimo que queres cambiar es el mother